香菜黑腐病主要为害根茎部和叶柄基部，多在近地上处患病，有时也侵染根，患病后受害部先变灰褐色，扩展后变成暗绿色至黑褐色，初病部表皮完好无损，后决裂露出皮下患病安排变黑腐朽，尤以根冠部易腐朽，叶下垂，呈干枯状，腐朽处很少向上或向下扩展，病部生出许多小黑点，即病原菌的分生孢子器。严重的外叶腐朽掉落。
【病原形状特征】
phoma apiicola Kleb．称香菜茎点霉，属半知菌亚门真菌。稚嫩菌丝初无色，老熟后长成黑色，在马铃薯琼脂培养基上能发生小菌核。分生孢子器球形或半球形，黑色，初埋生后外露，多在不明显的斑点中构成；分生孢子器上具孔口，产孢细胞多单细胞，产孢办法为瓶梗式别于叶点霉菌。
分生孢子单胞无色，长椭圆形，巨细3．0～3．8×1．0～1．6微米。病菌生长发育和分生孢子萌生温限5～30℃，16～18℃最适。
【防治方法】
1、对重茬重病地块实施2年轮作。结合深翻，收成后完全整理病残体，铲除病原。栽培过程中及时去除病株，消除病原。
2、加强田间管理，合理安排栽培密度，避免茎叶郁蔽。雨后及时排水，避免雨水流入棚内。浇水切忌洪流漫灌，及时通风排湿。
3、药剂防治。
发病初期，选用36%甲基硫菌灵悬浮剂400倍液，或10%双效灵水剂250倍液每667平方米喷50～60kg，7～10天1次，连防2～3次。
或用75%百菌清可湿性粉剂700～800倍液，40%甲霜铜可湿性粉剂700～800倍液，1：0.5：200的波尔多液，50%多菌灵可湿性粉剂800倍液，77%可杀得可湿性粉剂500倍液，50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500倍液，每7～10天喷1次，接连2～3次。大棚内用45%百菌清烟雾剂，于黄昏封闭大棚进行熏烟，每667米2每次0.25千克。也可用5%的百蓖清粉尘剂进行喷粉，每667米2每次1千克。